Национальный удостоверяющий центр (НУЦ) образован в 2000 году государственным унитарным предприятием Научно-технический центр «Атлас» и двумя крупнейшими банками - акционерным коммерческим банком «Банк внешней торговли» (Внешторгбанк) и Банком внешнеэкономической деятельности СССР (Внешэкономбанк).
На протяжении ряда лет деятельность Национального удостоверяющего центра была направлена на достиже
ние целей, прописанных в его Уставе, среди которых развитие и обеспечение функционирования системы электронного документооборота во всех сферах хозяйственной деятельности и гражданского оборота, обеспечение максимально широкого доступа к ней граждан и организаций, защита прав и законных интересов всех пользователей системы электронного документооборота, разрешение споров и конфликтов между ними.
Новый этап в деятельности организации начался в 2005 году, когда Национальный удостоверяющий центр организовал на базе филиалов ФГУП «Научно-производственное предприятие «Гамма» сеть центров регистрации, развернув аппаратно-программные комплексы в Санкт-Петербурге, Нижнем Новгороде, Ростове-на-Дону, Екатеринбурге и Новосибирске. В 2007 году создан центр регистрации в Хабаровске.
В 2010 году Национальный удостоверяющий центр одним из первых получил статус Авторизованного удостоверяющего центра для государственного (муниципального) заказа, вся деятельность центра осуществляется на основе лицензий ФСБ России.
Сертификат Национального удостоверяющего центра внесен в Единый государственный реестр сертификатов и ключей подписей удостоверяющих центров (Регистрационный номер записи П44-05-12-753) который ведет Министерство связи и массовых коммуникаций Российской Федерации - уполномоченный Федеральный орган исполнительной власти в области использования электронной цифровой подписи.
Национальный удостоверяющий центр функционирует в строгом соответствии с требованиями действующего законодательства Российской Федерации в данной области деятельности.
Национальный удостоверяющий центр оказывает услуги удостоверяющего центра в Федеральном агентстве по промышленности, Федеральном агентстве по культуре и кинематографии, является удостоверяющим центром системы Торгово-промышленной палаты Российской Федерации.
Национальный удостоверяющий центр присоединен к единой системе удостоверяющих центров в области электронной цифровой подписи (Свидетельство № 126 от 16 сентября 2011 года)
